La Colombie abrite environ 14 % de la biodiversité mondiale, mais l'expansion rapide des licences minières, pétrolières et gazières, et d'infrastructure — environ 24 des quelque 79 millions d'hectares de couverture naturelle restante du pays ont été autorisés pour l'exploration et le développement — a créé une pression en faveur d'une méthode standardisée de compensation des pertes de biodiversité inévitables issues des projets sous licence.
S'appuyant sur la loi 99 de 1993 (article 50) et la résolution 1503 de 2010, le ministère colombien de l'Environnement a adopté la résolution 1517 de 2012, établissant le Manuel pour l'attribution des compensations pour perte de biodiversité (MACPB) — intégré par la suite au Manuel de compensations du composant biotique plus large, mis à jour en 2018 puis en 2026 par l'Autorité nationale des licences environnementales (ANLA). Le manuel impose aux titulaires de licences des secteurs miniers, des hydrocarbures, des infrastructures, électrique, maritime et portuaire de compenser les impacts résiduels sur la biodiversité selon un ratio fondé sur la science combinant quatre facteurs — représentation dans les aires protégées, rareté écologique, étendue restante par rapport à la distribution historique, et taux de perte sur les six années précédentes — chacun noté de 1:1 (aucun écart) à 3:1 (omission complète). Un projet pilote à l'échelle du paysage appliquant ce cadre dans cinq zones sous pression de développement (mine de charbon à Cesar, mine d'or à Sur de Bolívar, port à Bahía Tribugá, route à Meta, pétrole et gaz à Casanare) a montré que compenser 2 518 ha d'écosystème naturel menacé chevauchant l'exploitation charbonnière à Cesar nécessitait 12 890 ha de compensations — des ratios individuels de 7:1 à 9:1 selon la rareté de l'écosystème.
En pratique, ce cadre a généré de véritables compensations foncières. Pour le barrage hydroélectrique de Hidrosogamoso, l'exploitant ISAGEN, l'autorité des parcs nationaux (Parques Nacionales Naturales de Colombia) et l'ONG Patrimonio Natural ont acheté 40 propriétés privées à l'intérieur du parc national Serranía de los Yariguíes (59 063 ha, département de Santander) pour la restauration écologique entre 2013 et 2018.
Un examen académique indépendant (publié dans Sustainability, 2013, et des études ultérieures sur les conflits politiques) documente des lacunes importantes : la sécurisation des compensations n'était historiquement exigée que pour une période de trois ans — jugée 'clairement inadéquate' par les chercheurs face à des impacts de développement permanents — et le choix des sites a souvent manqué d'une véritable équivalence écologique avec les zones endommagées. Des critiques, dont des groupes environnementaux écrivant dans le bulletin du World Rainforest Movement, estiment que les compensations peuvent aider les projets extractifs à se donner une image de réparation environnementale tout en poursuivant la perte de biodiversité, plutôt que de garantir une absence de perte nette vérifiée.
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