evidoria

← Back to browse

Good practice

Plataforma Suíça de Vigilância de Agentes Patogénicos (SPSP) — Vigilância Epidémica Genómica com IA

Switzerland · Lausanne · See the Switzerland profile

A SPSP integra análise genómica com IA para detetar variantes de agentes patogénicos em toda a Suíça. Com mandato do FOPH desde 2021, processou mais de 165 000 isolados de SARS-CoV-2, transmite relatórios 3×/semana e classificou-se em 4.º lugar mundial nas sequências partilhadas.

165,089
Isolados de SARS-CoV-2 detidos (2024)
1,293
Isolados de gripe e VSR (2024)
235
Outros isolados virais (2024)
7,194
Conjuntos de dados de aguas residuais (2024)
26
Cantoes abrangidos
Plataforma Suíça de Vigilância de Agentes Patogénicos (SPSP) — Vigilância Epidémica Genómica com IA

Details

Maturity
Established
Promoter
SIB Swiss Institute of Bioinformatics / Swiss Federal Office of Public Health
Period
2021–present
Keywords
public health, disease surveillance, genomics, epidemiology

Context

A Swiss Pathogen Surveillance Platform (SPSP) e uma infraestrutura nacional de vigilancia genomica com inteligencia artificial, criada pelo SIB Swiss Institute of Bioinformatics por mandato do Gabinete Federal de Saude Publica (FOPH). Estabelecida durante a COVID-19 (2020-2021), abrange agora tambem a gripe, o VSR e outros agentes patogenicos prioritarios.

Activities

A SPSP agrega sequencias de genoma completo de laboratorios de todos os 26 cantoes suicos, aplica analise filogenetica automatizada baseada em aprendizagem automatica para classificar variantes e transmite relatorios de vigilancia ao FOPH tres vezes por semana, partilhando dados abertamente na GISAID.

Results

Em 2024, a plataforma detinha 165 089 isolados de SARS-CoV-2, 1 293 isolados de gripe e VSR, 235 outros isolados virais e 7 194 conjuntos de dados de aguas residuais, tendo sido citada internacionalmente como modelo de integracao de vigilancia nacional de agentes patogenicos.

Implementation

Implementation detail (cost, timeline, staffing, conditions for success) is not yet available for this practice.

Data sources

Where this practice's information was retrieved from, and when.

Attachments

Similar practices you may find useful