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Boa prática Importada

Plataforma Suíça de Vigilância de Agentes Patogénicos (SPSP) — Vigilância Epidémica Genómica com IA

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A SPSP integra análise genómica com IA para detetar variantes de agentes patogénicos em toda a Suíça. Com mandato do FOPH desde 2021, processou mais de 165 000 isolados de SARS-CoV-2, transmite relatórios 3×/semana e classificou-se em 4.º lugar mundial nas sequências partilhadas.

165,089
Isolados de SARS-CoV-2 detidos (2024)
1,293
Isolados de gripe e VSR (2024)
235
Outros isolados virais (2024)
7,194
Conjuntos de dados de aguas residuais (2024)
26
Cantoes abrangidos
Plataforma Suíça de Vigilância de Agentes Patogénicos (SPSP) — Vigilância Epidémica Genómica com IA

Detalhes

Maturidade
Consolidada
Promotor
SIB Swiss Institute of Bioinformatics / Swiss Federal Office of Public Health
Período
2021–present
Palavras-chave
public health, disease surveillance, genomics, epidemiology

Contexto

A Swiss Pathogen Surveillance Platform (SPSP) e uma infraestrutura nacional de vigilancia genomica com inteligencia artificial, criada pelo SIB Swiss Institute of Bioinformatics por mandato do Gabinete Federal de Saude Publica (FOPH). Estabelecida durante a COVID-19 (2020-2021), abrange agora tambem a gripe, o VSR e outros agentes patogenicos prioritarios.

Atividades

A SPSP agrega sequencias de genoma completo de laboratorios de todos os 26 cantoes suicos, aplica analise filogenetica automatizada baseada em aprendizagem automatica para classificar variantes e transmite relatorios de vigilancia ao FOPH tres vezes por semana, partilhando dados abertamente na GISAID.

Resultados

Em 2024, a plataforma detinha 165 089 isolados de SARS-CoV-2, 1 293 isolados de gripe e VSR, 235 outros isolados virais e 7 194 conjuntos de dados de aguas residuais, tendo sido citada internacionalmente como modelo de integracao de vigilancia nacional de agentes patogenicos.

Implementação

Os detalhes de implementação (custo, prazo, equipa, condições de sucesso) ainda não estão disponíveis para esta prática.

Habitualmente financiado por

National / regional programmes

Vias de financiamento indicativas para práticas deste tipo — verifique sempre os avisos abertos e as regras de elegibilidade de cada programa.

Implementa esta prática? Reivindique-a — implementadores verificados obtêm um contacto público na página e podem propor correções.

Fontes de dados

De onde foi obtida a informação desta prática, e quando.

Anexos

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