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Plataforma Suiza de Vigilancia de Patógenos (SPSP) — Vigilancia epidémica genómica con IA

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La SPSP integra análisis genómico con IA para detectar variantes de patógenos en Suiza. Con mandato de la Oficina Federal de Salud Pública desde 2021, ha procesado 165.000+ aislados de SARS-CoV-2, transmite informes 3×/semana y se clasificó 4.ª mundial en secuencias compartidas.

165,089
Aislados de SARS-CoV-2 albergados (2024)
1,293
Aislados de gripe y VRS (2024)
235
Otros aislados virales (2024)
7,194
Conjuntos de datos de aguas residuales (2024)
26
Cantones cubiertos
Plataforma Suiza de Vigilancia de Patógenos (SPSP) — Vigilancia epidémica genómica con IA

Detalles

Madurez
Consolidada
Promotor
SIB Swiss Institute of Bioinformatics / Swiss Federal Office of Public Health
Período
2021–present
Palabras clave
public health, disease surveillance, genomics, epidemiology

Contexto

La Swiss Pathogen Surveillance Platform (SPSP) es una infraestructura nacional de vigilancia genomica con inteligencia artificial, creada por el SIB Swiss Institute of Bioinformatics por mandato de la Oficina Federal de Salud Publica (FOPH). Establecida durante la COVID-19 (2020-2021), ahora cubre tambien la gripe, el VRS y otros patogenos prioritarios.

Actividades

La SPSP agrega secuencias de genoma completo de laboratorios de los 26 cantones suizos, aplica analisis filogenetico automatizado basado en aprendizaje automatico para clasificar variantes y transmite informes de vigilancia a la FOPH tres veces por semana, compartiendo los datos abiertamente en GISAID.

Resultados

En 2024, la plataforma albergaba 165 089 aislados de SARS-CoV-2, 1 293 aislados de gripe y VRS, 235 otros aislados virales y 7 194 conjuntos de datos de aguas residuales, y ha sido citada internacionalmente como modelo de integracion de la vigilancia nacional de patogenos.

Implementación

Los detalles de implementación (coste, plazo, personal, condiciones para el éxito) aún no están disponibles para esta práctica.

Habitualmente financiado por

National / regional programmes

Vías de financiación indicativas para prácticas de este tipo: compruebe siempre las convocatorias vigentes y las reglas de elegibilidad de cada programa.

¿Usted implementa esta práctica? Reivindíquela — los implementadores verificados obtienen un contacto público en la página y pueden proponer correcciones.

Fuentes de datos

De dónde se obtuvo la información de esta práctica, y cuándo.

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